综合产量和药用成分含量两方面因素，种子繁育种苗的重楼在移栽后第6～8年采收最佳；带顶芽根茎的种苗在移栽后第4～5年采收最佳。秋季倒苗前后，10～12月重楼地上茎枯萎后至翌年春季萌动前采挖，即3月以前均可收获。
采收方法
选择晴天采挖，采挖时尽量避免损伤根茎，保证重楼根茎的完好无损。重楼块茎大多生长在表土层，容易采挖，但还是要注意保持块茎完整；先割除茎叶，采挖时用洁净的锄头先在畦旁开挖40cm深的沟，然后用锄头从侧面开挖，挖出块茎，抖落泥土，清水刷洗干净后，趁鲜开片，片厚2—3毫米，晒干即可。阴天可用30℃左右微火烘干，以免糊化显胶质。
产地加工
挖取的重楼，去净泥土和茎叶，把带顶芽部分切下留作种苗，其余部分晾晒干燥或烘干，打包或装麻袋贮藏。以粗壮、坚实、断面白、粉性足者为佳。
包装贮藏
重楼包装材料采用干燥、清洁、无异味以及不影响品质的材料制成，包装要牢固、密封、防潮，能保护品质，包装材料应易回收、易降解。在包装外标签上注明品名、等级、数量、收获时间、地点、合格证、验收责任人。有条件的基地注明农药残留、重金属含量分析结果和药用成分含量。
包装好的重楼商品药材，及时贮存在清洁、干燥、阴凉、通风、无异味的专用仓库中，要防止霉变、鼠害、虫害，注意定期检查。
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